ولادت: 1265ق.
محل ولادت:بهار همدان
وفات:1325ق.
محل دفن: بهار همدان
محل تحصیل: همدان ، بروجرد، نجف
اساتید: حضرات ملا عباسعلی بهاری ، اسماعیل همدانی ، میرزا محمود بروجردی و...
استاد عرفان: آخوند ملا حسینقلی همدانی
تالیفات: تذکره المتقین، کتاب القضاء
او پس از گذراندن تحصیلات مقدماتی در بهار همدان و اخذ درجه اجتهاد در بروجرد ، برای ادامه تحصیلات رهسپار نجف اشرف شد و درآن حوزه به محضر عارف کبیر ملا حسینقلی همدانی راه یافت. آخوند همدانی درباره آیت الله بهاری می فرمود: حاج شیخ محمد بهاری حکیم اصحاب من است . مرحوم بهاری و مرحوم سید احمد کربلایی از اعاظم شاگردان ملا حسینقلی بودند. از سید احمد کربلایی در عظمت شان آیت الله محمد بهاری نقل است . ما پیوسته در خدمت ملا حسینقلی همدانی بودیم و ایشان صد در صد مال ما بود ولی همین که آقای بهاری با آخوند روابط آشنایی بست ، آخوند دائما در خدمت او بود. شیوه تربیتی این آیت عظیم همان روش استادش ملا حسینقلی همدانی بود و در همان برخورد اول طرف مقابل را مجذوب و شیفته خود می ساخت. روزی رهگذر در نجف به طلاب جسارتی کرد. ایشان به رهگذر رو کرد و گفت : آیا نخواهی مرد؟ وقت آن نرسیده که از خواب غفلت بیدار شوی؟ آن مرد عرض کرد : " چرا چرا ! اتفاقا موقعش رسیده " سپس توبه کرد و بعدها در زمره زهاد و اوتاد زمان خود درآمد.
آیت الله محمد بهاری در نجف به بیماری مزمنی دچار شد و پزشکان راه علاج او را تغییر آب و هوا دانستند. وی به ایران بازگشت اما وضع جسمانی اش بدتر شد و دیگر نتوانست به نجف باز گردد. در زمان حیات به او پیشنهاد کردند که بعد از رحلت، جنازه اش را به نجف منتقل کنند ولی او با قاطعیت فرمود: مرا در گورستان بهار دفن کنید، می خواهم کنار شهیدان باشم . سال ها بعد بیش از 160تن از شهیدان جنگ ایران و عراق در قبرستان بهار آرمیدند و اکنون مرقد منور مرحوم بهاری در این قبرستان زیارتگاه مردم است ! علامه تهرانی می گوید: این گونه شنیده ام و بدان اعتقاد دارم که آن مرحوم از میهمانان خود پذیرایی می کند. عارف بزرگ آیت الله محمد جواد انصاری همدانی که بارها برای زیارت قبر ایشان و استمداد از روح بلند او راه دوازده کیلومتری تا بهار را پیاده طی کرده بود ،درباره عظمت شخصیت عرفانی آیت الله محمد بهاری می فرمود : من بعد از قبر سلمان فارسی ، قبری را به نورانیت محمد بهاری در بهار همدان ندیده ام.