حضرت امام محمدتقی علیه السلام در آخر ذی‌القعده‌‏ی سال 220 قمری درسن بیست و پنج سالگی بر اثر زهری که به دستور معتصم عباسی، توسط ام‏‌الفضل همسر آن حضرت (دختر مأمون) به ایشان خورانده شد در بغداد به شهادت رسیدند و در کنار مرقد منور جد گرامی‌شان، حضرت امام موسی کاظم علیه السلام مدفون گردید.

آن حضرت در سن هشت سالگی به امامت رسیدند و هفده سال امامت نمودند و به هنگام شهادت در 25 سالگی، جوان‏‌ترین امام بودند. امامتِ حضرت با حکومت دو طاغوت زمان، مأمون ومعتصم عباسی همزمان بوده است.

شهادت زود هنگام آن حضرت، گویای این نکته است که فعالیت‌‏های امام جواد در پاسداری از فرهنگ و ارزش‌‏های اسلامی تا چه اندازه برای حکومت‏‌های جور و ستم، خطر آفرین بوده است.